Разработан дыхательный тест на основе РНК для выявления COVID-19 и разновидности штамма

В новом исследовании, опубликованном в журнале "Journal of Molecular Diagnostics", ученые сообщают о разработке и испытании тестера Bubbler, который основан на обнаружении вирусной РНК для диагностики SARS-CoV-2.

Bubbler не только осуществляет обратную транскрипцию РНК вирусных частиц из воздуха в ДНК для анализа методом ПЦР, но также может наносить штрих-код на эту ДНК, что позволяет связать образцы непосредственно с пациентом, от которого они получены, и использовать их для секвенирования. Он предоставляет дополнительную информацию, такую как вирусная нагрузка на организм и способен определять штамм вируса.


Обнаружение вирусов с помощью Bubbler похоже на ПЦР-тест больничного мазка, однако это более точный показатель риска заражения, поскольку он выявляет вирусные частицы, передающиеся воздушно-капельным путем. Анализы мазков могут давать положительный результат в течение нескольких месяцев после заражения, поскольку они обнаруживают фрагменты вирусной РНК в клетках, которые сохраняются в ранее инфицированных клетках. Bubbler также может быть адаптирован для отбора проб окружающей среды в больницах, транспортных узлах и закрытых помещениях, таких как офисы, корабли и самолеты, сообщают исследователи.

Было обследовано 70 пациентов, проходивших лечение в отделении неотложной помощи больницы Род-Айленда в период с мая 2020 года по январь 2021 года. В ходе исследования были протестированы образцы из трех точек дыхательных путей. Соскобы со рта (слюна/соскобы с языка) и 15 секунд выдыхаемого воздуха, собранные в Бабблер, сравнивались с результатами обычного ПЦР-теста мазка из носоглотки. Bubbler - это стеклянная трубка со стеклянной пипеткой, через которую пациенты могут выдыхать. Трубка заполняется реакционной смесью для обратной транскрипции и холодным минеральным маслом.

Исследование показало, что SARS-CoV-2 может быть легко обнаружен в дыхании и является более предсказуемым для поражения нижних дыхательных путей. Вирусная РНК более обогащена в дыхании по сравнению с оральными образцами, а оральные образцы включают клетки, участвующие в репликации SARS-CoV-2, чего нет в оральных образцах. Это позволяет предположить, что вирусный сигнал, обнаруженный в "Бабблере", исходит от активных вирусных частиц.


Для тестирования на COVID-19 обычно используются образцы, собранные из верхних дыхательных путей слюной или мазком из носоглотки. Положительные образцы содержат активный вирус, но вирусная нагрузка в верхних дыхательных путях не коррелирует с симптомами в нижних дыхательных путях, такими как пневмония.